Suomen Englanninkääpiöterrierit ry:n vaatimus yhdistyksen pentulistalle pääsemiseksi on, että pentueen molemmilla vanhemmilla on astutushetkellä voimassa olevat viralliset silmä- ja polvitarkastuslausunnot. Sydänkuuntelutulosta suositellaan. Näitä noudatetaan lähes poikkeuksetta ja koiria tutkitaan, vaikka niitä ei jalostukseen käytettäisikään. 

Rodussa seurataan silmäsairauksia, etenkin HC:n (perinnöllinen harmaakaihi) kehittymistä ja rotu on mukana Hannes Lohen koirien geenitutkimuksessa. Nuorten koirien vitsauksena on usein sikaripunkki (demodikoosi), jota yleensä ei tarvitse hoitaa, vaan se paranee itsestään. Kennelliiton Jalostustietokannasta löytyy virallisten terveystutkimusten tulokset. http://jalostus.kennelliitto.fi/

JDCM eli juveniili kardiomyopatia on nuoruusiän sydänlihassairaus, josta löytyy taustatietoa Kanadan manchesterinterrieriyhdistyksen sivuilta http://www.canadamt.com/juvenile-cardiomyopathy-study.html. Minnesotan yliopistossa löydettiin JDCM:n aiheuttava geeni ja siihen valmistui geenitesti kesällä 2016. Suomen Englanninkääpiöterrierit Ry:n sivuilta lisää tietoa sairaudesta ja lista geenitestatuista koirista. http://www.englishtoyterriers.fi/node/263